上海交大海洋水下工程科学研究院有限公司，是目前国内唯一集潜水生理医学和海洋水下工程技术方面的科研、工程施工、专业设备开发销售的综合性水下工程技术研究和开发单位。公司所有制性质为国有企业，经济类型为有限责任公司（合资公司），是国家高新技术企业，企业资信等级AAA。
上海交大海洋水下工程科学研究院有限公司前身是国家交通部1978年批准成立的专业从事海上救捞潜水与水下工程技术研究的部属一级科研单位。初期暂定名为交通部海上救捞科学研究院（筹）。1982年定名为交通部石油部海洋水下工程科学研究院，由交通部和石油部共管。2001年3月，随着国家体制改革，整建制并入上海交通大学，名为上海交通大学海洋水下工程科学研究院。2004年4月，由上海交通大学申请并经教育部批复，以上海交通大学海洋水下工程科学研究院为骨干班底成立上海交大海科（集团）有限公司。2016年3月依据沪交委组〔2015〕130号文，由原来的上海交通大学海洋水下工程科学研究院和上海交大海科（集团）有限公司更名为上海交大海洋水下工程科学研究院有限公司（以下简称上海交大海科院），系学校的直管企业。
上海交大海科院地址为上海市徐汇区龙吴路1500号，现有土地面积34亩，房屋建筑面积20,416平方米。现有正式员工107多名，其中事业职工47名。本科以上学历76名，其中博士4名（含海外博士1名）。教授、研究员6名，副教授、副研究员、高级工程师、高级会计师33名，中级技术职称37名。资产总额为12151.09万元，其中固定资产3914.36万元，流动资产6958.81万元。